Il funzionamento pulsante è un particolare accorgimento che consiste in una successione di periodi di potenza superiore del 50-80% alla potenza normale, seguiti da uguali periodi di potenza zero. Si adotta questo particolare modo di funzionamento per due scopi:

fornire sia pure per pochi istanti una potenza ultrasonora notevolmente maggiorata rispetto a quella normale

avere poi altrettanti istanti di quiete assoluta per bloccare la formazione delle onde stazionarie

Questo utilizzo è conveniente nei casi, dove un martellamento a potenza maggiorata è preferibile ad una azione continua ed uniforme. Questi casi sono quelli in cui il materiale da asportare è connesso alla superficie del pezzo, cioè ad esempio nel caso di ossidazioni, incrostazioni calcaree, vernici vetrificate, influorescenze o gemmazioni di materiale organico.